Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN7P35236 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms