Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA4P35212 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA4P35212 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms