Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRMP28827 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
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