Protein–RNA interactions for Protein: P25106

ACKR3, Atypical chemokine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR3P25106 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR3P25106 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR3P25106 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR3P25106 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR3P25106 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR3P25106 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms