Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
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