Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSR1P21757 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSR1P21757 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MSR1P21757 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSR1P21757 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSR1P21757 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSR1P21757 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSR1P21757 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSR1P21757 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSR1P21757 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSR1P21757 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSR1P21757 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSR1P21757 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSR1P21757 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSR1P21757 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSR1P21757 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSR1P21757 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSR1P21757 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms