Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT1P21579 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT1P21579 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms