Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

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Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NF1P21359 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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