Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD247P20963 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD247P20963 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD247P20963 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD247P20963 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD247P20963 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD247P20963 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD247P20963 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD247P20963 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD247P20963 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD247P20963 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms