Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms