Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms