Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB2P05107 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms