Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms