Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGFRP00533 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGFRP00533 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGFRP00533 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGFRP00533 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGFRP00533 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGFRP00533 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGFRP00533 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGFRP00533 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGFRP00533 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGFRP00533 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGFRP00533 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGFRP00533 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGFRP00533 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGFRP00533 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGFRP00533 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGFRP00533 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGFRP00533 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGFRP00533 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGFRP00533 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGFRP00533 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EGFRP00533 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGFRP00533 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGFRP00533 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGFRP00533 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EGFRP00533 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EGFRP00533 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EGFRP00533 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGFRP00533 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms