Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms