Protein–RNA interactions for Protein: O95406

CNIH1, Protein cornichon homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1O95406 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNIH1O95406 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms