Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG7O95352 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG7O95352 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms