Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms