Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHP4O75161 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms