Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms