Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms