Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CRXO43186 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CRXO43186 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CRXO43186 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CRXO43186 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRXO43186 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRXO43186 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms