Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCAO15360 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCAO15360 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCAO15360 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCAO15360 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCAO15360 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCAO15360 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCAO15360 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCAO15360 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCAO15360 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms