Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
VGFO15240 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
VGFO15240 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VGFO15240 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VGFO15240 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VGFO15240 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VGFO15240 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGFO15240 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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