Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms