Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNMO15061 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNMO15061 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNMO15061 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNMO15061 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNMO15061 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNMO15061 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNMO15061 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNMO15061 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNMO15061 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms