Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APAF1O14727 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APAF1O14727 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms