Protein–RNA interactions for Protein: O00560

SDCBP, Syntenin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBPO00560 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDCBPO00560 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms