Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms