Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms