Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms