Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WIPF3A6NGB9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms