Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZNF316A6NFI3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms