Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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SNX13Q9Y5W8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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SNX13Q9Y5W8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
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SNX13Q9Y5W8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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