Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms