Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms