Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms