Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms