Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms