Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms