Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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TPCN1Q9ULQ1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
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TPCN1Q9ULQ1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPCN1Q9ULQ1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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