Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms