Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms