Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms