Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms