Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms