Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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