Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms