Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CWC25Q9NXE8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms