Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms